GABA được tìm thấy chủ yếu dưới dạng zwitterion (nghĩa là với nhóm carboxyl bị khử và nhóm amin bị proton hóa). Hình dạng của nó phụ thuộc vào môi trường của nó. Trong pha khí, một cấu trúc gấp rất cao được ưa chuộng mạnh mẽ do lực hút tĩnh điện giữa hai nhóm chức năng. Sự ổn định là khoảng 50 kcal/mol, theo tính toán hóa học lượng tử. Ở trạng thái rắn, một cấu trúc mở rộng được tìm thấy, với cấu trúc trans ở đầu amino và cấu trúc gạc ở đầu carboxyl. Điều này là do các tương tác đóng gói với các phân tử lân cận. Trong giải pháp, năm sự phù hợp khác nhau, một số gấp và một số mở rộng, được tìm thấy như là kết quả của hiệu ứng hòa tan. Tính linh hoạt về hình dạng của GABA rất quan trọng đối với chức năng sinh học của nó, vì nó đã được tìm thấy để liên kết với các thụ thể khác nhau với sự phù hợp khác nhau. Nhiều chất tương tự GABA với các ứng dụng dược phẩm có cấu trúc cứng hơn để kiểm soát liên kết tốt hơn.[38]